Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHLHA9Q7RTU4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHA9Q7RTU4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms