Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWSAP1Q6NVH7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SWSAP1Q6NVH7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms