Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CARD17Q5XLA6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms