Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRAGBQ5VZM2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms