Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC30Q5VVM6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC30Q5VVM6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC30Q5VVM6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms