Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210 ms