Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI3KQ59H18 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNI3KQ59H18 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms