Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL24A1Q17RW2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL24A1Q17RW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
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