Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME3Q16798 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ME3Q16798 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME3Q16798 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ME3Q16798 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ME3Q16798 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ME3Q16798 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ME3Q16798 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ME3Q16798 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ME3Q16798 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME3Q16798 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME3Q16798 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME3Q16798 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME3Q16798 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME3Q16798 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME3Q16798 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME3Q16798 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME3Q16798 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME3Q16798 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME3Q16798 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ME3Q16798 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ME3Q16798 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME3Q16798 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ME3Q16798 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME3Q16798 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME3Q16798 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME3Q16798 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME3Q16798 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME3Q16798 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME3Q16798 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ME3Q16798 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ME3Q16798 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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