Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB35Q15286 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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RAB35Q15286 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB35Q15286 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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