Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NID2Q14112 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NID2Q14112 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NID2Q14112 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NID2Q14112 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NID2Q14112 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NID2Q14112 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NID2Q14112 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NID2Q14112 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NID2Q14112 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NID2Q14112 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NID2Q14112 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NID2Q14112 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NID2Q14112 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NID2Q14112 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NID2Q14112 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NID2Q14112 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NID2Q14112 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NID2Q14112 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NID2Q14112 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NID2Q14112 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NID2Q14112 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NID2Q14112 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NID2Q14112 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NID2Q14112 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NID2Q14112 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NID2Q14112 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NID2Q14112 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NID2Q14112 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NID2Q14112 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
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NID2Q14112 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NID2Q14112 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NID2Q14112 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NID2Q14112 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NID2Q14112 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NID2Q14112 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NID2Q14112 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NID2Q14112 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NID2Q14112 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NID2Q14112 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NID2Q14112 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NID2Q14112 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NID2Q14112 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NID2Q14112 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NID2Q14112 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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