Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTCH1Q13635 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTCH1Q13635 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTCH1Q13635 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
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