Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH18Q13634 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH18Q13634 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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