Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKRN4PQ13434 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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