Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCGB2A2Q13296 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms