Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM32Q13049 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM32Q13049 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM32Q13049 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM32Q13049 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM32Q13049 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms