Protein–RNA interactions for Protein: Q06830

PRDX1, Peroxiredoxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX1Q06830 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRDX1Q06830 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX1Q06830 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms