Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC18A2Q05940 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.1 ms