Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKCEQ02156 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms