Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POU5F1Q01860 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POU5F1Q01860 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms