Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCQ00610 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLTCQ00610 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCQ00610 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCQ00610 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCQ00610 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCQ00610 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCQ00610 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CLTCQ00610 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CLTCQ00610 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CLTCQ00610 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLTCQ00610 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CLTCQ00610 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLTCQ00610 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLTCQ00610 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CLTCQ00610 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLTCQ00610 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLTCQ00610 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLTCQ00610 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLTCQ00610 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCQ00610 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCQ00610 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms