Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC18A1P54219 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms