Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYBA4P53673 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms