Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCIP41743 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms