Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV3P41162 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV3P41162 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV3P41162 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV3P41162 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETV3P41162 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV3P41162 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV3P41162 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV3P41162 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV3P41162 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV3P41162 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV3P41162 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV3P41162 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV3P41162 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV3P41162 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV3P41162 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV3P41162 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV3P41162 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV3P41162 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETV3P41162 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV3P41162 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV3P41162 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV3P41162 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV3P41162 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV3P41162 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV3P41162 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV3P41162 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV3P41162 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV3P41162 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV3P41162 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV3P41162 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV3P41162 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV3P41162 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV3P41162 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV3P41162 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV3P41162 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV3P41162 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV3P41162 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms