Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SERPINF1P36955 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERPINF1P36955 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms