Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT2P35908 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT2P35908 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT2P35908 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT2P35908 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT2P35908 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT2P35908 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT2P35908 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT2P35908 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT2P35908 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT2P35908 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT2P35908 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT2P35908 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT2P35908 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT2P35908 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT2P35908 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT2P35908 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT2P35908 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT2P35908 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT2P35908 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT2P35908 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT2P35908 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT2P35908 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT2P35908 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT2P35908 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT2P35908 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT2P35908 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT2P35908 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT2P35908 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT2P35908 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT2P35908 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT2P35908 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT2P35908 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT2P35908 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT2P35908 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT2P35908 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT2P35908 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT2P35908 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT2P35908 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT2P35908 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT2P35908 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms