Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN7P35236 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms