Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETSIPP0DME0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETSIPP0DME0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SETSIPP0DME0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms