Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TNP1P09430 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms