Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM3P06753 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM3P06753 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM3P06753 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM3P06753 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM3P06753 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM3P06753 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM3P06753 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM3P06753 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM3P06753 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM3P06753 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM3P06753 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM3P06753 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TPM3P06753 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPM3P06753 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms