Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESR1P03372 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESR1P03372 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESR1P03372 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESR1P03372 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESR1P03372 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESR1P03372 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESR1P03372 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESR1P03372 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESR1P03372 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESR1P03372 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESR1P03372 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESR1P03372 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESR1P03372 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESR1P03372 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESR1P03372 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESR1P03372 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESR1P03372 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESR1P03372 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESR1P03372 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESR1P03372 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESR1P03372 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESR1P03372 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESR1P03372 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESR1P03372 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESR1P03372 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESR1P03372 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESR1P03372 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESR1P03372 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESR1P03372 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESR1P03372 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms