Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RECQL4O94761 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RECQL4O94761 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms