Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP3O75386 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP3O75386 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP3O75386 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP3O75386 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP3O75386 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP3O75386 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP3O75386 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP3O75386 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP3O75386 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP3O75386 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP3O75386 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP3O75386 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP3O75386 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP3O75386 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP3O75386 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP3O75386 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms