Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM4AO75164 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM4AO75164 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms