Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A4O43246 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC7A4O43246 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms