Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SUPT5HO00267 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SUPT5HO00267 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SUPT5HO00267 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SUPT5HO00267 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms