Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KR12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KR12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KR12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KR12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KR12 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KR12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KR12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KR12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KR12 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KR12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KR12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KR12 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KR12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KR12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KR12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KR12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KR12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
J3KR12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
J3KR12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
J3KR12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KR12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KR12 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KR12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms