Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB1P1B2RPK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB1P1B2RPK0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms