Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187AA6NFU0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM187AA6NFU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM187AA6NFU0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM187AA6NFU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms