Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABD2BA6NFA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABD2BA6NFA1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRABD2BA6NFA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRABD2BA6NFA1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms