Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHGA8Q9Y5G5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHGA8Q9Y5G5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms