Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP15Q9Y4E8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP15Q9Y4E8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP15Q9Y4E8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms