Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NOP58Q9Y2X3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms