Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF6Q9Y252 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF6Q9Y252 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms