Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF3Q9ULD4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF3Q9ULD4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms