Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C4Q9UKN8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C4Q9UKN8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms