Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPREB3Q9UKI3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPREB3Q9UKI3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms