Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms