Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2IRD1Q9UHL9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms